D2R_GPCR_Viz_Based_GPCR二聚体界面接触动态数据

数据集概述

本数据集记录了多巴胺受体D2(D2R)同源二聚体不同激活状态(非活性、活性、 arrestin结合态)下的界面接触动态信息,包含氢键、π-阳离子、π-堆积等相互作用类型。通过分子动力学模拟跟踪界面残基接触,可通过指定平台可视化动态变化,支持GPCR二聚体结构机制研究。

文件详解

  • 文件类型:JSON格式文件,共27个
  • 命名规则:以二聚体激活状态组合+相互作用类型命名,如6CM4-6CM4(非活性-非活性)、6VMS-6VMS(活性-活性)等状态组合,对应hydrogenbonds(氢键)、saltbridge(盐桥)、pistacking(π-堆积)等相互作用文件
  • 内容说明:每个文件记录对应二聚体构型下特定界面接触的动态数据,可上传至https://gpcrviz.github.io/flareplot/生成动态flareplot可视化

数据来源

GPCR二聚体计算框架研究(未明确具体机构/论文)

适用场景

  • GPCR二聚体结构机制研究:分析不同激活状态下D2R同源二聚体的界面相互作用模式
  • 分子动力学模拟验证:对比模拟结果与实验结构的界面接触一致性
  • 药物靶点设计辅助:基于界面残基相互作用特征优化D2R靶向药物的结合亲和力
  • 生物信息学可视化应用:利用flareplot工具展示二聚体界面接触的动态变化规律
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 1.56 MiB
最后更新 2026年1月25日
创建于 2026年1月25日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。