数据集概述
本数据集围绕混合测序数据中等位基因和单倍型频率估计的精度优化展开,包含实验数据、分析脚本及相关文档,支持对DNA混合变异、测序深度等因素影响的研究,为混合测序实验设计提供方法与实证支持。
文件详解
- 文档说明文件:
- README_for_Simulation_script_Fig.1Fig.S1-4.txt: TXT格式,包含数据集相关说明及联系方式
- 分析脚本文件:
- Simulation_script_Fig.1Fig.S1-4.Rmd、Simulation_script_Fig.1Fig.S1-4.html: R语言脚本及输出文件,用于模拟分析
- DNAconcentration_estimation_script_Fig.2-3.Rmd、DNAconcentration_estimation_script_Fig.2-3.html: R语言脚本及输出文件,用于DNA浓度估计
- 数据文件:
- PipetteMetrology.csv: CSV格式,包含移液器计量数据,字段有Brand、Model、SerialNumber、Year、Theoretical、Observed等
- DataPicogreen.csv: CSV格式,包含Picogreen实验数据,字段有Experiment、Sample、ReadingPlate、mass、Concentration等
- DataHoechst.csv: CSV格式,包含Hoechst实验数据
- 基因组数据文件:
- GenomicData.zip: ZIP格式压缩包,包含基因组相关数据
适用场景
- 分子生物学研究: 优化混合测序实验设计,提高等位基因频率估计精度
- 生物信息学分析: 开发和验证混合测序数据分析模型
- 实验方法学研究: 评估DNA混合变异对测序结果的影响
- 植物遗传学研究: 应用于苜蓿等植物的单倍型频率估计研究