数据集概述
该数据集包含典型SNARE蛋白相关的额外研究数据,涵盖系统发育树、序列比对、生物化学实验结果(如圆二色谱、尺寸排阻色谱数据)及蛋白质电泳凝胶图像等,为相关研究提供补充数据支持。
文件详解
- 文档说明文件:
- README_tree_fasta.md:Markdown格式,描述系统发育树与序列比对数据,包括53个氨基酸的SNARE基序比对文件(.fasta)和计算树文件(.tree)的对应关系
- README_extra data.rtf:RTF格式,额外数据的说明文档
- README_biochemistry.rtf:RTF格式,生物化学实验数据的说明文档
- Neveu et al_singlespeciestrees.pdf:PDF格式,单物种系统发育树文档
- 原始数据文件:
- All CD spectra recorded.txt:TXT格式,包含圆二色谱(CD)数据,字段含波长(Wavelength, nm)及多组实验数据(如HPS1-run1、HPS1-run2a等)
- 压缩包文件:
- Trees and Alignments.zip:压缩包,包含系统发育树(.tree)和序列比对(.fasta)文件
- Size exclusion chromatography data.zip:压缩包,尺寸排阻色谱原始数据
- Native and SDS-PAGE data.zip:压缩包,天然及SDS-PAGE凝胶相关数据
- 图像文件:
- 2020_02_25_1 native.png:PNG格式,天然凝胶图像
适用场景
- 分子生物学研究:分析SNARE蛋白的系统发育关系与序列特征
- 生物化学实验分析:研究SNARE蛋白的结构(圆二色谱)及相互作用(尺寸排阻色谱)
- 蛋白质组学研究:探索SNARE蛋白的电泳行为与表达特性
- 生物信息学分析:验证SNARE蛋白相关的系统发育树构建方法