数据集概述
本数据集包含在五十摄氏度下，阳离子型（电荷：正一）DMTAP脂质、DMPC脂质、水及中和离子（必要时）组成的不同系统的构型与参数，覆盖纯DMPC及六种DMTAP比例的混合体系。
文件详解
- 脂质构型文件（PDB格式）：共十一个，对应不同DMTAP比例的脂质系统，包含脂质、水和中和离子的原子坐标
- 纯DMPC：dmpc128_20ns.pdb，含一百二十八个DMPC脂质、三千六百五十五个水分子
- 百分之六DMTAP：tap06_20ns.pdb，含一百二十个DMPC、八个DMTAP脂质、八个氯离子、三千六百四十七个水分子
- 百分之十六DMTAP：对应PDB文件，含一百零八个DMPC、二十个DMTAP脂质、二十个氯离子、三千六百三十五个水分子
- 百分之二十五DMTAP：对应PDB文件，含九十六个DMPC、三十二个DMTAP脂质、三十二个氯离子、三千六百二十三个水分子
- 百分之三十一DMTAP：tap31_20ns.pdb，含八十八个DMPC、四十个DMTAP脂质、四十个氯离子、三千六百一十五个水分子
- 百分之三十九DMTAP：tap39_20ns.pdb，含七十八个DMPC、五十个DMTAP脂质、五十个氯离子、三千六百零五个水分子
- 百分之五十DMTAP：对应PDB文件，含六十四个DMPC、六十四个DMTAP脂质、六十四个氯离子、三千五百九十一个水分子
- 百分之六十三DMTAP：对应PDB文件，含四十八个DMPC、八十个DMTAP脂质、八十个氯离子、三千五百七十五个水分子
- 百分之八十九DMTAP：对应PDB文件，含十四个DMPC、一百一十四个DMTAP脂质、一百一十四个氯离子、三千五百四十一个水分子
- 纯DMTAP：dmtap128_24ns.pdb，含一百二十八个DMTAP脂质、一百二十八个氯离子、三千五百二十七个水分子
- 脂质参数文件（ITP格式）：共两个
- dmpc.itp：DMPC脂质的分子动力学参数文件
- dmtap.itp：DMTAP脂质的分子动力学参数文件
- 汇总文档（PDF格式）：TablePDB.pdf，含各系统的脂质面积及误差数据
适用场景
- 生物物理研究：分析不同比例阳离子脂质对膜结构的影响
- 分子动力学模拟：作为初始构型和参数，开展脂质膜相关模拟研究
- 药物递送研究：探究阳离子脂质体的组成与性能关系
- 膜生物学：研究脂质膜的物理化学性质随组成的变化规律
