数据集概述
本数据集包含DMPC双分子层的200纳秒分子动力学模拟数据，采用Gromos 53A6力场与Berger脂质参数构建，系统含128个DMPC脂质与3655个SPC水分子，共16853个原子，模拟前已平衡52纳秒，提供脂质面积与厚度分析结果。
文件详解
- 模拟配置与参数文件：
- dmpc.itp：ITP格式，脂质拓扑参数文件
- npt-membrane-continue.mdp：MDP格式，模拟参数配置文件
- 模拟输入输出文件：
- dmpc128-200ns.tpr：TPR格式，模拟运行输入文件
- dmpc128-200ns.trr：TRR格式，轨迹文件
- dmpc128-200ns.gro：GRO格式，结构文件
- dmpc128-200ns.edr：EDR格式，能量数据文件
- dmpc128-200ns.cpt：CPT格式，检查点文件
- 分析结果文件：
- dmpc128-200ns-thickness-fs.png：PNG格式，脂质双分子层厚度分析图
- dmpc128-200ns-apl-fs.png：PNG格式，单脂质面积分析图
适用场景
- 生物物理研究：分析DMPC脂质双分子层结构特性
- 分子动力学方法验证：测试Gromos 53A6力场对磷脂双分子层模拟的适用性
- 膜生物学研究：探究脂质双分子层在323K条件下的动态行为
- 计算模拟性能评估：评估GTX980M硬件平台的分子动力学模拟效率
