数据集概述
本数据集为双壳类（Bivalvia）系统发育研究的RNA-seq数据，包含31种双壳类的转录组数据及已发表基因组、转录组数据。通过系统发育基因组学分析，构建了双壳类可靠的系统发育框架，解决了原鳃亚纲、异齿亚纲等类群的单系性及古异齿亚纲等类群的系统位置问题，可支持宏观进化理论验证。
文件详解
- 文档文件
- 文件名称：README_for_Dryad_Data.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：说明数据集对应论文信息，提及包含Supermatrices、Loci_alignments、SuperQ input tree files三个目录共1383个文件
- 压缩文件
- 文件名称：Dryad_Data.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：压缩包内含三个目录，其中Supermatrices目录含3个OMA超级矩阵文件，Loci_alignments目录含1377个单基因座比对文件，SuperQ input tree files目录含3个输入树文件
数据来源
Dryad数据库（对应论文：A phylogenetic backbone for Bivalvia: an RNA-seq approach）
适用场景
- 双壳类系统发育研究：基于超级矩阵和基因座比对数据，分析双壳类深层节点的系统发育关系
- 分子进化分析：利用转录组和基因组数据，探究双壳类关键类群的进化速率与适应性进化机制
- 宏观进化理论验证：通过已解析的系统发育框架，测试生物多样性起源、形态演化等宏观进化假说
- 生物信息学方法应用：参考RNA-seq数据的处理与系统发育基因组学分析流程，优化无脊椎动物相关研究方法
