数据集概述
本数据集记录多年生黑麦草受粉红雪霉(Microdochium nivale)早期感染时的转录组变化,包含抗病与感病基因型的转录组序列及差异表达基因、GO富集分析结果,用于研究非低温驯化条件下的抗病分子机制,共4个文件。
文件详解
- 差异基因与GO分析文件
- 文件名称:significant_GO_Terms_fisherstest.xlsx、EST_candidategenes_snowmould.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含粉红雪霉感染相关的显著GO术语(经Fisher检验)、候选基因信息,支持抗病机制的功能富集与关键基因筛选
- 转录组序列文件
- 文件名称:Snowmould_Resistant_genotype_Trinity_transcriptome.fasta、Snowmould_Susceptible_genotype_Trinity_transcriptome.fasta
- 文件格式:FASTA
- 字段映射介绍:分别记录抗病基因型、感病基因型的Trinity组装转录组序列,包含转录本ID及核苷酸序列信息
适用场景
- 植物抗病分子机制研究:分析抗病与感病基因型的转录组差异,挖掘粉红雪霉早期感染的关键抗病基因
- 功能基因组学分析:利用GO富集结果解析多年生黑麦草应对病原菌的生物学过程与分子功能
- 分子标记开发:基于候选基因信息开发粉红雪霉抗性相关的分子标记,辅助抗病育种
- 转录组组装参考:提供抗病、感病基因型的完整转录组序列,支持植物病理转录组研究的序列比对与注释