共生绿藻属系统转录组关系研究的组装与比对数据集2024

数据集概述

该数据集为研究共生绿藻属(Oophila)与两栖动物卵团相关的系统转录组关系提供数据支持,包含基因组组装、序列比对、进化树文件及补充图表,覆盖绿藻物种的转录组序列与系统发育分析材料。

文件详解

  • 压缩文件:
  • Oophila_treefiles_logfiles_August2024.zip: 压缩格式,包含进化树文件与日志文件,用于系统发育分析
  • Oophila_final_alignments_stats_August2024.zip: 压缩格式,包含最终序列比对结果与统计数据
  • 基因组转录本文件:
  • C_pseudogloeogama_genome_myCC_20211109_0220_4mer_0.7_Cluster.5.all.maker.transcripts.fasta: FASTA格式,假球藻属基因组转录本序列
  • C_nasuta_genome_Cluster.1.all.maker.transcripts.fasta: FASTA格式,纳斯塔藻基因组转录本序列
  • 补充图表文件:
  • Figure_S1.jpg: JPG格式,补充图表1
  • Figure_S2.jpg: JPG格式,补充图表2
  • Figure_S3.jpg: JPG格式,补充图表3
  • Figure_S4.jpg: JPG格式,补充图表4

适用场景

  • 藻类系统发育研究: 分析共生绿藻属的进化关系与分类地位
  • 转录组学分析: 探究绿藻物种的基因表达与功能特征
  • 共生关系机制研究: 解析绿藻与两栖动物卵团的共生分子基础
  • 进化生物学研究: 构建绿藻物种的系统发育树,追溯演化历程
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 19.68 MiB
最后更新 2025年12月10日
创建于 2025年12月10日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。