GPCRchimeraDB_Based_生物信息学GPCR嵌合受体数据完整分析

数据集概述

该数据集包含GPCRchimeraDB数据库的核心数据及生成所需文件,涵盖天然与嵌合GPCR条目、三维结构、系统发育树、多序列比对等生物信息学资源,为GPCR相关研究提供结构化数据支持。

文件详解

  • chimera_not_in_DB.xlsx:Excel格式文件,包含非A类及跨类嵌合设计(未入库)、待考虑的未入库设计
  • 2504_naturals.zip:压缩文件,数据库中所有天然GPCR的条目文件
  • 2504_chimeras.zip:压缩文件,数据库中所有嵌合GPCR的条目文件
  • 3Dstructures.zip:压缩文件,包含天然与嵌合条目相关的三维结构、模型、dssp文件及映射文件
  • Files_required_generate_JSON.zip:压缩文件,生成条目文件所需的原始文件,需结合GitHub代码仓库处理
  • PhylogeneticSublass.zip:压缩文件,基于PMID:27028541扩展的系统发育树分类文件
  • MasterAlignment.zip:压缩文件,数据库中所有哺乳动物GPCR的多序列比对文件,用于数据库的比对工具

适用场景

  • 生物信息学研究:分析GPCR家族的系统发育关系、序列保守性及结构特征
  • 药物研发:基于GPCR结构与序列数据开展靶点发现、药物分子设计研究
  • 数据库构建:复现或扩展GPCRchimeraDB的条目生成流程与数据架构
  • 计算生物学:利用多序列比对、三维结构数据进行蛋白质功能预测与进化分析
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 376.03 MiB
最后更新 2025年12月15日
创建于 2025年12月15日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。