数据集概述
本数据集为绵羊遗传性交界性表皮松解症(JEB)致病突变研究的关联分析文件。研究通过GWAS定位JEB位点至绵羊11号染色体,结合RNA-seq发现ITGB4基因外显子33的4bp缺失突变,证实其为致病原因。数据集包含关联分析相关文件,支持绵羊JEB遗传机制研究与育种应用。
文件详解
- 文件名称:AssociationFiles_PLINK.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩包包含GWAS关联分析相关文件,具体字段需解压后查看,推测涵盖基因型数据、表型数据、关联分析结果等PLINK标准格式内容,用于绵羊JEB致病位点的定位与验证。
数据来源
论文“Combining GWAS and RNA-seq approaches for detection of the causal mutation for hereditary junctional epidermolysis bullosa in sheep”
适用场景
- 绵羊遗传性疾病致病机制研究:分析ITGB4基因4bp缺失突变对蛋白功能及疾病表型的影响。
- 动物育种遗传标记开发:基于致病突变开发分子标记,用于Churra绵羊群体JEB病的选育净化。
- 人类皮肤病动物模型研究:利用患病绵羊建立人类交界性表皮松解症(伴皮肤发育不全)的大动物模型。
- 多组学联合分析方法验证:验证GWAS与RNA-seq联合策略在非模式动物致病突变检测中的有效性。