数据集概述
本数据集围绕Heliconius蝴蝶适应性颜色模式分化与趋同的基因组结构展开,通过全基因组重测序等技术,分析了其杂交区的遗传变异,识别了调控红色颜色模式变异的基因组区间,探究了适应性等位基因的进化历史,为理解生物多样性起源提供支撑。
文件详解
- 序列与进化分析文件(.nex格式,共19个)
- 示例文件:melperato_manalignSNPsD515to580Bayes_DATATREE.nex、best_D_515to580KSplitstreeDATA.nex、wgserato_Dregion_aligned.nex等
- 内容说明:包含基因组区间的序列比对、单核苷酸多态性(SNP)数据、群体遗传分析结果及系统发育树构建数据,涉及不同基因组区域(如65kb趋异区域、2.2Mb参考序列片段)的遗传变异分析
- 压缩文件(.zip格式,共1个)
- 文件名称:vcfs4dryad.zip
- 内容说明:推测包含全基因组重测序产生的VCF格式数据,记录了Heliconius erato和Heliconius melpomene不同颜色模式种群的基因变异信息
数据来源
论文“Genomic architecture of adaptive color pattern divergence and convergence in Heliconius butterflies”
适用场景
- 适应性进化基因组机制研究:分析蝴蝶颜色模式趋异与趋同的遗传基础,识别调控表型的关键基因组区域
- 群体遗传学分析:探究杂交区种群的基因流动、遗传分化及适应性等位基因的进化历史
- 比较基因组学研究:对比两种共拟态蝴蝶的遗传结构,验证共享或独立的进化模式
- 表型-基因型关联分析:解析颜色模式表型与基因组变异位点的对应关系,挖掘调控表型的顺式调控元件
- 生物多样性起源研究:通过蝴蝶颜色模式的适应性变异,理解自然选择驱动生物多样性形成的分子机制