数据集概述
本数据集为暗黑鳃金龟触角转录组分析的原始数据,包含KEGG通路富集分析注释的代谢与信号通路、FuncTree软件可视化的功能潜力,以及OBPs、CSPs等嗅觉候选基因的鉴定结果,还涉及系统发育分析、热图与qRT-PCR实验相关数据,共5个文件。
文件详解
- 文件1:Amino acid and nucleotide sequences of identified OBPs, CSPs, SNMPs and ODEs from H. parallela.docx
- 文件格式:DOCX
- 字段映射介绍:记录暗黑鳃金龟中鉴定出的OBPs、CSPs、SNMPs和ODEs的氨基酸与核苷酸序列信息
- 文件2:Genes obtained from other species for the phylogenetic analysi.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含用于系统发育分析的其他物种基因数据
- 文件3:The number of KOs in biological process, pathway and module layers.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:统计生物过程、通路和模块层面的KO数量
- 文件4:Identification and characteristics of putative olfactory genes.docx
- 文件格式:DOCX
- 字段映射介绍:描述推测的嗅觉基因的鉴定过程及其特征
- 文件5:The number of unigenes and KOs based on KEGG pathway enrichment analysis.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:基于KEGG通路富集分析得到的unigenes和KO数量统计
适用场景
- 昆虫分子生物学研究: 分析暗黑鳃金龟代谢通路、信号通路及嗅觉基因功能
- 系统发育分析: 利用不同物种基因数据研究暗黑鳃金龟与其他物种的亲缘关系
- 基因表达验证: 结合热图与qRT-PCR数据,研究嗅觉基因在不同性别、组织中的表达特征
- 功能基因组学分析: 通过FuncTree可视化结果,探究暗黑鳃金龟unigenes在多层面的功能潜力