胡萝卜沿海亚种变异基因型测序数据集

数据集概述

本数据集聚焦胡萝卜属(Daucus)中沿海"gummifer"形态型亚种的遗传变异,通过基因型测序(GBS)分析288份样本,涵盖地中海、大西洋沿岸及巴利阿里群岛等区域,识别出29041个过滤后的单核苷酸多态性(SNPs),为该类群的分类与系统发育研究提供数据支持。

文件详解

该数据集包含4个文件,具体说明如下: - 图表文件: - MartinezFlores21Sep19-Fig1.pdf: PDF格式,可能为研究的关键图表(如系统发育树或样本分布图) - 补充表格: - MartinezFlores07Jan20-Supplemental_Table_1.xlsx: Excel格式,补充表格1,可能包含样本信息、SNP统计或分类结果等数据 - 基因型数据: - Daucus_carota_vcf_file_29041SNPs.vcf.gz: 压缩VCF格式,包含29041个过滤后的SNPs基因型数据 - 系统发育数据: - Daucus_carota_phylip.phy.phy: PHYLIP格式,可能为用于构建系统发育树的序列比对数据

适用场景

  • 植物分类学研究: 分析胡萝卜属沿海亚种的分类地位与亲缘关系
  • 群体遗传学分析: 探究"gummifer"形态型的遗传结构与地理分化模式
  • 系统发育研究: 基于SNPs数据构建胡萝卜属亚种的系统发育树
  • 植物资源保护: 为地中海及大西洋沿岸胡萝卜属野生资源的保护提供遗传背景信息
  • 进化生物学研究: 探讨沿海环境对植物形态与遗传变异的选择压力
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 36.0 MiB
最后更新 2025年12月23日
创建于 2025年12月23日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。