基因序列转录本正向序列数据集GeneSequenceTranscriptPositiveDataset-nadaabdellatef
数据来源:互联网公开数据
标签:基因组学,转录组学,DNA序列,蛋白质序列,生物信息学,基因注释,序列分析,生物学
数据概述:
该数据集包含来自公开数据库的基因转录本正向序列信息,记录了与蛋白质相关的DNA序列特征。主要特征如下:
时间跨度:数据未明确标注时间,可视为静态基因组数据。
地理范围:数据来源未明确,但涵盖了多个物种的基因组信息。
数据维度:数据集包含多个字段,包括:SmProtID(蛋白质序列标识符),DNAseq(DNA序列),DNAlength(DNA序列长度),startCodon(起始密码子),stopCodon(终止密码子),startCodonSite(起始密码子位点),stopCodonSite(终止密码子位点),transcriptID(转录本标识符),corresponding_EnsemblTranscriptIDs(对应的Ensembl转录本ID),corresponding_transcriptBiotypes(对应的转录本生物类型),transcriptDNAseq(转录本DNA序列),corresponding_EnsemblGeneIDs(对应的Ensembl基因ID),corresponding_geneBiotypes(对应的基因生物类型),dataSource(数据来源),IsHighConfidence(置信度)。
数据格式:CSV格式,文件名为positive_original_data.csv,易于数据分析和处理。
来源信息:数据来源于生物信息学数据库,已进行标准化处理。
该数据集适合用于基因表达分析、蛋白质结构预测、生物序列比对等研究。
数据用途概述:
该数据集具有广泛的应用潜力,特别适用于以下场景:
研究与分析:适用于基因组学、转录组学等领域的学术研究,如基因结构分析、转录调控机制研究等。
行业应用:可以为生物制药、生物技术公司提供数据支持,尤其在药物靶点发现、基因治疗等方面。
决策支持:支持生物信息学研究中的数据分析和模型构建,辅助科研人员进行实验设计和结果分析。
教育和培训:作为生物信息学、基因组学等课程的教学辅助材料,帮助学生深入理解基因组数据。
此数据集特别适合用于探索基因序列与蛋白质结构、功能的关联,以及转录本的生物学特性,帮助用户进行基因功能预测、疾病相关基因研究等。