数据集概述
本数据集围绕孔雀鱼及近缘鱼类染色体GC含量的区域差异展开,通过内含子GC含量间接推断其染色体重组模式。研究基于重组与GC偏向基因转换的关联,使用内含子序列和密码子第三位碱基序列(弱选择压力位点)进行分析,验证孔雀鱼染色体末端高GC值与雄性减数分裂交叉定位的关系,同时识别未确定的着丝粒末端。
文件详解
该数据集包含多种类型文件,具体说明如下:
- 图片文件(.png格式,共70个):
- 示例文件:G14_HOMOPLOT.png、LG20_P21_G_GC3.png、PICTA_GC_LG3_FIN.png等
- 内容:展示染色体GC含量分布、同源区域对比等可视化结果,如GC值分布图、同源性分析图等
- 文档文件(.docx格式,共4个):
- 示例文件:GC_Picta_Description_Fixed.docx、List_of_Python_and_r_code_for_Dryad.docx
- 内容:研究描述文档、代码文件清单等说明性文本
- 代码文件(共3个):
- Python代码:code.py、maincode.py(.py格式)
- R代码:intronicGC(LOESS).R(.r格式)
- 内容:用于数据处理和分析的脚本文件
- 数据文件(.xlsx格式,共2个):
- 示例文件:Autosomal_segregation_results_(by_LG).xlsx
- 内容:常染色体分离结果等结构化数据表格
- PDF文件(.pdf格式,共4个):
- 示例文件:GC3_CPA_guppy.pdf、GC_intron_Platyfishplot.pdf
- 内容:GC含量分析结果的PDF报告或图表
适用场景
- 进化遗传学研究:分析孔雀鱼及近缘鱼类染色体重组模式的进化机制
- 基因组学分析:验证GC偏向基因转换与重组率的关联
- 性别决定机制研究:探究孔雀鱼XY染色体对的重组模式特性
- 生物信息学方法应用:基于GC含量推断染色体着丝粒位置的方法验证
- 比较基因组学:对比不同鱼类物种染色体结构与GC含量的关系