孔雀鱼及近缘鱼类染色体GC含量区域差异研究数据集

数据集概述

本数据集围绕孔雀鱼及近缘鱼类染色体GC含量的区域差异展开,通过内含子GC含量间接推断其染色体重组模式。研究基于重组与GC偏向基因转换的关联,使用内含子序列和密码子第三位碱基序列(弱选择压力位点)进行分析,验证孔雀鱼染色体末端高GC值与雄性减数分裂交叉定位的关系,同时识别未确定的着丝粒末端。

文件详解

该数据集包含多种类型文件,具体说明如下: - 图片文件(.png格式,共70个): - 示例文件:G14_HOMOPLOT.png、LG20_P21_G_GC3.png、PICTA_GC_LG3_FIN.png等 - 内容:展示染色体GC含量分布、同源区域对比等可视化结果,如GC值分布图、同源性分析图等 - 文档文件(.docx格式,共4个): - 示例文件:GC_Picta_Description_Fixed.docx、List_of_Python_and_r_code_for_Dryad.docx - 内容:研究描述文档、代码文件清单等说明性文本 - 代码文件(共3个): - Python代码:code.py、maincode.py(.py格式) - R代码:intronicGC(LOESS).R(.r格式) - 内容:用于数据处理和分析的脚本文件 - 数据文件(.xlsx格式,共2个): - 示例文件:Autosomal_segregation_results_(by_LG).xlsx - 内容:常染色体分离结果等结构化数据表格 - PDF文件(.pdf格式,共4个): - 示例文件:GC3_CPA_guppy.pdf、GC_intron_Platyfishplot.pdf - 内容:GC含量分析结果的PDF报告或图表

适用场景

  • 进化遗传学研究:分析孔雀鱼及近缘鱼类染色体重组模式的进化机制
  • 基因组学分析:验证GC偏向基因转换与重组率的关联
  • 性别决定机制研究:探究孔雀鱼XY染色体对的重组模式特性
  • 生物信息学方法应用:基于GC含量推断染色体着丝粒位置的方法验证
  • 比较基因组学:对比不同鱼类物种染色体结构与GC含量的关系
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 12.25 MiB
最后更新 2025年12月12日
创建于 2025年12月12日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。