昆虫后代微生物组与家庭生活及镉摄入关联研究数据集

数据集概述

本数据集包含社会性昆虫后代微生物组研究的相关数据,涉及家庭生活方式、镉摄入剂量对微生物组的影响,包含样本信息、分析脚本、序列数据及补充材料,支持研究结果复现。

文件详解

  • 样本信息文件:
  • cd_data.txt:TXT格式,包含样本ID、家族、镉处理剂量(0、25或100mg/L)、若虫社会环境(隔离、同胞、家庭)等变量信息
  • 分析脚本文件:
  • Cadmium_script.R:R格式,用于执行研究中的生物信息学处理与分析,需配合make_biom.R代码使用
  • make_biom.R:R格式,为Cadmium_script.R提供源代码支持
  • R数据对象文件:
  • ps_proka.RData:RData格式,初始phyloseq对象,用于统计分析
  • core.RData:RData格式,核心计算后的phyloseq对象,可直接用于统计分析
  • 序列数据文件:
  • R1R2.zip:ZIP格式,包含Illumina MiSeq测序的16S rRNA基因V3-V4区序列(fastq格式)
  • 补充材料文件:
  • Supplemental Material.pdf:PDF格式,含补充表格(如DESeq2分析结果)和图表(如电泳图、稀释曲线)

适用场景

  • 昆虫微生物组研究:分析家庭生活方式对社会性昆虫后代微生物组的影响
  • 重金属污染研究:探究镉摄入剂量与昆虫微生物组的关联
  • 生物信息学分析:复现16S rRNA基因序列的处理与统计分析流程
  • 环境因素与微生物组关联研究:研究环境变量对生物微生物组的独立作用机制
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 430.45 MiB
最后更新 2025年12月20日
创建于 2025年12月20日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。