数据集概述
本数据集包含论文《LKRSDH-dependent histone modifications of insulin-like peptide sites contribute to age-related circadian rhythm changes》的相关数据与脚本，涉及RNA-seq、CHIP-seq分析及图表生成等内容，支持研究LKRSDH依赖的组蛋白修饰对胰岛素样肽位点及年龄相关昼夜节律变化的影响。
文件详解
- 代码文件（.r格式）
- 文件名称：RNA-seq code.R、CHIP-seq code.R、ClusterGVis code.R、boxplot code.R
- 文件格式：.r
- 内容说明：分别用于RNA-seq数据分析、CHIP-seq数据分析、聚类可视化分析、箱线图绘制的代码脚本
- 代码文件（.sh格式）
- 文件名称：RNA-seq.sh、CHIP-seq.sh
- 文件格式：.sh
- 内容说明：用于RNA-seq、CHIP-seq数据处理的shell脚本
- 数据文件（.xlsx格式）
- 文件名称：Fig.7 correlation.xlsx、Supp.Fig.7 heatmap.xlsx、Fig.7 Heatmap.xlsx、Supp.Fig.7 correlation.xlsx
- 文件格式：.xlsx
- 内容说明：包含图7相关性数据、补充图7热图数据、图7热图数据、补充图7相关性数据
- 数据文件（.xls格式）
- 文件名称：RNA-seq_all_gene_count.xls
- 文件格式：.xls
- 内容说明：RNA-seq所有基因的计数数据
数据来源
论文"LKRSDH-dependent histone modifications of insulin-like peptide sites contribute to age-related circadian rhythm changes" by Pengfei Lv, Xingzhuo Yang, Juan Du
适用场景
- 表观遗传学研究：分析LKRSDH依赖的组蛋白修饰对胰岛素样肽位点的调控机制
- 昼夜节律研究：探究年龄相关昼夜节律变化的分子机制
- 转录组数据分析：利用RNA-seq数据研究基因表达变化
- 生物信息学分析：通过提供的代码脚本复现论文中的数据分析与图表结果
