数据集概述
本数据集围绕陆生植物起源研究展开，聚焦基因序列污染与缺失数据对系统发育推断的影响，通过验证数据质量揭示陆生植物与轮藻目、鞘毛藻目类群的亲缘关系，包含研究相关的文档、序列文件及进化树数据。
文件详解
- 文档文件（PDF格式）：
- FigS3-54-Final.pdf、FigS55-109-Final.pdf：研究相关的补充图表文件
- Table_S1-Final.pdf、Table_S2-Final.pdf、Table_S3-Final.pdf：研究相关的补充表格文件
- 压缩文件（ZIP格式）：
- 164-single-gene-before-SCaFoS.zip：单基因数据压缩包（处理前）
- RAxML-Trees.zip：RAxML方法构建的进化树压缩包
- Phylobayes-Trees.zip：Phylobayes方法构建的进化树压缩包
- FINET-sineContam-Trees.zip：去污染后的进化树压缩包
- 序列文件（NEX格式）：
- Finet-99.nex：Finet数据集的序列文件
- Complete-22360.nex：完整数据集的序列文件
- Not-Complete-43300.nex：非完整数据集的序列文件
适用场景
- 植物系统发育研究：分析陆生植物与藻类类群的亲缘关系
- 基因组学研究：探究基因序列污染对系统发育推断的影响
- 进化生物学研究：验证数据质量对物种演化关系结论的影响
- 生物信息学方法评估：比较不同系统发育分析方法（如RAxML、Phylobayes）的结果差异
