数据集概述
该数据集是manabuishii/yevis-getting-started项目中的工作流之一,围绕日本基因型表型档案库(JGA)的全基因组测序(WGS)数据处理展开,包含工作流配置、质量控制脚本、元数据及说明文档等文件,为JGA数据用户提供标准化的数据分析流程支持。
文件详解
- 文件名称: README.md,文件格式: Markdown(.md),内容: 介绍JGA数据分析工作流的说明文档,提及JGA中全基因组测序数据格式及处理需求。
- 文件名称: yevis-metadata-1.0.0.yml,文件格式: YAML(.yml),内容: 工作流的元数据配置文件。
- 文件名称: qc-filter.cwl,文件格式: CWL(.cwl),内容: 质量控制过滤步骤的工作流描述文件。
- 文件名称: qc-report.cwl,文件格式: CWL(.cwl),内容: 质量控制报告生成步骤的工作流描述文件。
- 文件名称: wf_engine_params.json,文件格式: JSON(.json),内容: 工作流引擎参数配置文件,结构为无键的空对象。
- 文件名称: wf_params.json,文件格式: JSON(.json),内容: 工作流参数配置文件。
数据来源
manabuishii/yevis-getting-started
适用场景
- 生物信息学研究: 用于JGA全基因组测序数据的标准化处理与分析。
- 工作流开发: 作为CWL工作流配置与质量控制流程设计的参考案例。
- 基因组数据管理: 辅助理解JGA数据从原始测序到变异检测的处理流程。
- 生物医学数据分析: 为基于JGA基因型-表型数据的关联研究提供流程支持。