manabuishii_yevis_getting_started_JGA_Based_全基因组测序数据处理工作流完整数据

数据集概述

该数据集是manabuishii/yevis-getting-started项目中的工作流之一,围绕日本基因型表型档案库(JGA)的全基因组测序(WGS)数据处理展开,包含工作流配置、质量控制脚本、元数据及说明文档等文件,为JGA数据用户提供标准化的数据分析流程支持。

文件详解

  • 文件名称: README.md,文件格式: Markdown(.md),内容: 介绍JGA数据分析工作流的说明文档,提及JGA中全基因组测序数据格式及处理需求。
  • 文件名称: yevis-metadata-1.0.0.yml,文件格式: YAML(.yml),内容: 工作流的元数据配置文件。
  • 文件名称: qc-filter.cwl,文件格式: CWL(.cwl),内容: 质量控制过滤步骤的工作流描述文件。
  • 文件名称: qc-report.cwl,文件格式: CWL(.cwl),内容: 质量控制报告生成步骤的工作流描述文件。
  • 文件名称: wf_engine_params.json,文件格式: JSON(.json),内容: 工作流引擎参数配置文件,结构为无键的空对象。
  • 文件名称: wf_params.json,文件格式: JSON(.json),内容: 工作流参数配置文件。

数据来源

manabuishii/yevis-getting-started

适用场景

  • 生物信息学研究: 用于JGA全基因组测序数据的标准化处理与分析。
  • 工作流开发: 作为CWL工作流配置与质量控制流程设计的参考案例。
  • 基因组数据管理: 辅助理解JGA数据从原始测序到变异检测的处理流程。
  • 生物医学数据分析: 为基于JGA基因型-表型数据的关联研究提供流程支持。
packageimg

数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 20.78 MiB
最后更新 2025年12月6日
创建于 2025年12月6日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。