数据集概述
本数据集围绕黄石国家公园White Creek氮限制溪流温度梯度下嗜热蓝细菌（Mastigocladus laminosus）种群展开研究，探究基因流与分化选择对遗传变异分布的影响。重点分析rfbC基因座及周边5kbp区域的选择信号，涉及SNP基因型、序列比对及基因组组装数据，共包含3个文件。
文件详解
- 文件名称：SNP_genotypes.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：包含rfbC基因座附近区域的SNP基因型数据，关联环境温度与基因多态性，用于分析选择目标区域的遗传变异
- 文件名称：Sequence alignments.tar
- 文件格式：TAR（归档文件）
- 字段映射介绍：压缩归档文件，包含研究中涉及的基因序列比对数据，支持遗传分化与选择信号的序列分析
- 文件名称：Mlam.Sequence_Assembly.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：嗜热蓝细菌（Mastigocladus laminosus）的基因组组装序列，包含NODE_45等组装节点的长度、覆盖度及核苷酸序列信息
数据来源
论文“Divergence with gene flow in a population of thermophilic bacteria: a potential role for spatially varying selection”
适用场景
- 进化生物学研究：分析基因流与分化选择在嗜热细菌种群遗传变异维持中的作用机制
- 微生物基因组学分析：通过基因组组装数据研究嗜热蓝细菌的基因组结构与功能基因分布
- 环境适应性研究：关联SNP基因型与环境温度梯度，探究细菌对热环境的适应性进化
- 选择信号检测：利用序列比对数据识别受空间异质选择作用的基因区域（如rfbC基因座）
- 微生物生态学研究：解析黄石公园溪流生态系统中嗜热细菌的种群遗传结构与环境关联
