数据集概述
本数据集是Maximillian R. W. Jones博士论文的补充数据集合，涵盖论文第2、3、4章的配套数据与文档。包含基因型、代谢物、表型、基因表达、实验设计等多类型数据，支持论文研究结果的验证与扩展分析。
文件详解
该数据集包含22个文件，按章节分类说明如下：
- 第2章补充数据:
- Supplementary_Data_2.1: 所有材料对之间的共享k-mer状态率矩阵
- Supplementary_Data_2.2.xlsx: 最小SNP面板位点及150个非冗余材料的基因型数据
- Supplementary_Data_2.3.xlsx: 183种选定代谢物的详细信息
- Supplementary_Data_2.4.docx: Tsedey基因组组装中含tef TT2同源基因A基因组拷贝的 scaffold（Et_4A_032842）
- Supplementary_Data_2.5.docx: Tsedey基因组组装中含tef TT2同源基因B基因组拷贝的 scaffold（Et_4B_039404）
- Supplementary_Data_2.6.xlsx: 研究中使用的材料详细信息
- Supplementary_Data_2.7.xlsx: 原始田间试验设计及基于冗余材料组定义的更新设计
- Supplementary_Data_2.8: 原始田间和谷物表型数据
- Supplementary_Information_2.docx: 包含补充表格及关于核心收集物最小SNP集基因分型的补充说明2.1
- 第3章补充数据:
- Supplementary_Data_3.1: 半空间穗RNA-seq样本中所有IWGSC RefSeq v1.1基因的计数和TPM值
- Supplementary_Data_3.2: 本章使用的引物信息
- Supplementary_Data_3.3.docx: 额外MJ_GG24 cDNA样本的凝胶电泳分析
- Supplementary_Data_3.4: 花器官大小参数逐步线性模型的显著交互作用数量
- Supplementary_Data_3.5.xlsx: 基部与中央穗部比较的DESeq2差异表达结果
- Supplementary_Data_3.6.zip: 本章使用的L0片段和L2构建体数据
- Supplementary_Data_3.7.txt: 使用ImageJ/FIJI进行MOF/mof1器官大小图像处理的详细方法
- Supplementary_Data_3.8: MJ_GG18表型数据
- Supplementary_Data_3.9: MJ_GG19表型数据
- Supplementary_Data_3.10: MOF/mof1整体表型数据
- Supplementary_Data_3.11.xlsx: MOF/mof1器官大小原始数据
- Supplementary_Data_3.12.zip: MOF/mof1花器官原始图像
- 第4章补充数据:
- Supplementary_Information_4.docx: 包含标签化协议的补充说明4.1
适用场景
- 作物基因组学研究: 分析材料间遗传差异及基因组结构特征
- 代谢组学分析: 研究选定代谢物的组成与功能关联
- 植物分子生物学研究: 验证基因表达模式及分子实验结果
- 田间试验设计优化: 参考冗余材料分组策略改进试验设计
- 植物表型组学分析: 应用ImageJ/FIJI图像处理方法进行器官表型量化
- 博士论文研究结果复现: 支持原论文各章节研究结论的验证与扩展分析
