酶催化反应底物序列数据集EnzymeCatalysisReactionSubstrateSequenceDataset-s95028
数据来源:互联网公开数据
标签:酶学,蛋白质序列,底物,SMILES,生物化学,分子结构,机器学习,生物信息学
数据概述:
该数据集包含酶催化反应的底物信息,记录了底物分子结构(以SMILES表示)以及与之对应的蛋白质序列。主要特征如下:
时间跨度:数据未明确标注时间信息,可视为静态的酶-底物相互作用数据集。
地理范围:数据来源于生物化学和分子生物学研究,未限定特定地理区域。
数据维度:数据集包含三个主要字段:Substrate(底物名称),Substrate SMILES(底物分子的SMILES编码,一种描述分子结构的字符串),以及Protein Sequence(蛋白质序列)。
数据格式:CSV格式,文件名为seq-SMILEScsv,便于处理和分析。
来源信息:数据来源于公开的生物信息学数据库或研究,具体来源未明确说明,但数据经过结构化处理。
该数据集特别适用于酶-底物相互作用的研究,以及基于结构和序列的生物信息学分析。
数据用途概述:
该数据集具有广泛的应用潜力,特别适用于以下场景:
研究与分析:适用于生物化学、分子生物学和生物信息学领域的学术研究,如酶催化机制研究、底物特异性预测、蛋白质结构-功能关系分析等。
行业应用:可为药物研发、生物催化等行业提供数据支持,尤其在药物设计、酶工程等领域具有潜在应用价值。
决策支持:支持生物技术公司和研究机构进行药物筛选、酶的定向改造以及生物催化过程优化。
教育和培训:作为生物化学、分子生物学和生物信息学相关课程的辅助材料,帮助学生和研究人员深入理解酶-底物相互作用。
此数据集特别适合用于探索底物分子结构与蛋白质序列之间的关系,从而预测酶的活性和特异性,并应用于药物设计和生物催化领域。