数据集概述
本数据集为Ofu岛（美属萨摩亚）礁湖珊瑚热胁迫实验的转录组研究数据，包含20个Acropora hyacinthus珊瑚群体在29℃（对照）和35℃（加热）条件下暴露5小时、20小时后的白化情况与转录组响应数据，涉及基因表达调控、转录组弹性与白化抗性的关联分析，共8个文件。
文件详解
- 设计与原始数据文件
fullRTEdesign.csv（CSV格式）：实验设计文件，包含样本的基因型、处理条件、位置、来源和时间点等元数据Supp_mat_Spreadsheet1_Raw_counts_data.xlsx（XLSX格式）：原始基因表达计数数据CombinedCounts_5h.txt（TXT格式）：5小时处理组的基因表达合并计数数据，含ContigName及各样本计数CombinedCounts_20h.txt（TXT格式）：20小时处理组的基因表达合并计数数据，含ContigName及各样本计数- 序列与注释文件
33496_Ahyacinthus_CoralContigs.fasta（FASTA格式）：Acropora hyacinthus珊瑚的Contig序列文件33496_Ahyacinthus_Contigs_Annotation.xlsx（XLSX格式）：Contig序列的注释信息- 分析代码文件
DESeqAnalysis5h_nov2013.R（R格式）：5小时处理组基因差异表达分析的R代码DESeqAnalysis20h_nov2013.R（R格式）：20小时处理组基因差异表达分析的R代码
数据来源
论文“The role of transcriptome resilience in resistance of corals to bleaching”
适用场景
- 珊瑚转录组弹性研究：分析热胁迫下珊瑚基因表达恢复能力与白化抗性的关联
- 珊瑚白化分子机制分析：探究热胁迫不同时间点的基因表达调控模式
- 珊瑚抗逆基因筛选：识别与转录组弹性相关的关键功能基因
- 海洋气候变化响应研究：为珊瑚应对极端温度的适应性进化研究提供数据支持
- 转录组数据分析方法参考：基于R代码的差异表达分析流程复用
