数据集概述
本数据集是发布于开放种系受体数据库(OGRDB)的小鼠AKR/J亚群IGLV受体种系参考集,包含4个相关文件,涵盖种系序列的带间隙、无间隙FASTA格式文件、JSON格式数据及许可文件,为免疫受体序列分析提供标准化参考数据。
文件详解
- J IGLV_rev_1_gapped.fasta
- 文件格式:FASTA
- 字段映射介绍:带间隙的IGLV受体种系序列文件,包含带插入间隙的免疫球蛋白轻链可变区种系基因序列
- J IGLV_rev_1_ungapped.fasta
- 文件格式:FASTA
- 字段映射介绍:无间隙的IGLV受体种系序列文件,包含去除插入间隙的免疫球蛋白轻链可变区种系基因序列
- J IGLV_rev_1.json
- 文件格式:JSON
- 字段映射介绍:IGLV受体种系数据的结构化文件,可能包含种系基因的元数据、序列注释等信息
- licence.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:许可文件,包含数据发布的版权声明及使用许可说明,采用CC0 1.0协议
数据来源
Open Germline Receptor Database (OGRDB)
适用场景
- 免疫受体种系序列分析: 用于小鼠AKR/J亚群IGLV受体种系基因的序列比对、注释与特征分析
- 生物信息学数据库构建: 作为标准化参考数据支撑免疫受体数据库的更新与完善
- 免疫遗传学研究: 助力研究小鼠免疫球蛋白轻链可变区的种系基因组成与进化特征
- 抗体工程应用: 为基于小鼠种系受体的抗体分子设计与改造提供序列参考