数据集概述
本数据集是发布于Open Germline Receptor Database(OGRDB)的小鼠A/J品系IGL-V基因胚系参考数据,包含未对齐、带空位的FASTA序列文件、JSON数据文件及许可说明文档,共4个文件,支持免疫受体基因相关研究。
文件详解
- 数据文件
- 文件名称:J IGLV_rev_2_ungapped.fasta
- 文件格式:FASTA
- 字段映射介绍:小鼠A/J品系IGL-V基因未对齐的胚系序列数据
- 文件名称:J IGLV_rev_2_gapped.fasta
- 文件格式:FASTA
- 字段映射介绍:小鼠A/J品系IGL-V基因带空位的胚系序列数据
- 文件名称:J IGLV_rev_2.json
- 文件格式:JSON
- 字段映射介绍:小鼠A/J品系IGL-V基因胚系数据的结构化信息
- 文档文件
- 文件名称:licence.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:包含Creative Commons CC0 1.0许可声明及版权相关说明
数据来源
Open Germline Receptor Database(OGRDB)
适用场景
- 免疫基因组学研究:分析小鼠A/J品系IGL-V基因的胚系序列特征与多样性
- 生物信息学工具开发:作为基准数据集测试免疫受体基因序列比对、注释工具的性能
- 比较基因组学分析:对比不同小鼠品系或物种间IG受体基因的进化差异
- 免疫相关疾病机制研究:为小鼠模型中B细胞受体基因重排机制研究提供基础数据
- 开源基因组数据应用:基于CC0许可开展无版权限制的免疫受体基因相关学术研究与应用开发