数据集概述
本数据集包含BeONE联盟收集的610株空肠弯曲菌样本的基因组组装数据,以及基因组组装统计信息、采样年份、国家、来源等元数据。数据通过标准化流程生成,经质量控制后纳入,可用于空肠弯曲菌的基因组特征分析及One Health监测研究。
文件详解
- BeONE_Cj_metadata.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含每株菌的基因组组装统计数据(如欧洲核苷酸档案登录号、in-silico多位点序列分型)、采样年份、国家及来源信息。
- BeONE_Cj_assemblies.zip
- 文件格式:ZIP
- 内容说明:压缩包内包含元数据文件中所有菌株的基因组组装序列,格式为.fasta。
数据来源
One Health European Joint Programme “BeONE: Building Integrative Tools for One Health Surveillance”项目
适用场景
- 空肠弯曲菌基因组特征研究:分析菌株的基因组结构、基因组成及遗传多样性。
- One Health监测:结合采样来源(如人、动物、环境)数据,研究空肠弯曲菌在不同宿主间的传播链。
- 分子分型与溯源:利用多位点序列分型数据开展菌株的分型及流行病学溯源分析。
- 公共卫生风险评估:基于基因组数据评估空肠弯曲菌的耐药性、毒力特征及公共卫生风险。