数据集概述
本数据集为欧洲小麦主要病原菌唑类杀菌剂抗性研究的补充资料,包含支撑研究结论的图表、表格及数据文件。核心围绕病原菌遗传多样性、抗性表型、基因关联分析等内容,为理解病原菌抗性机制提供补充数据支持。
文件详解
- 补充图表文件(Supplementary Figures S1-S12):以PDF格式呈现,含病原菌多样性、抗性表型等可视化结果,具体内容需查看PDF图例
- 补充表格文件(Supplementary Tables S1-S14):
- Table S1:病原菌分离株信息,含唑类杀菌剂EC50值、相对生长量等表型数据及样本分组
- Table S2:GWAS关联分析结果汇总,含不同杀菌剂抗性关联的SNP、SV、k-mer数据文件索引
- Table S3:显著关联的遗传变异(SNP、k-mer、SV)详情,含基因注释、HGVS蛋白变异等信息
- Table S4:Cyp51基因编码区SNP及插入缺失变异信息
- Table S5:Cyp51基因单倍型分布及抗性关联频率
- Table S6:Cyp51基因17个抗性关联SNP的功能注释
- Table S7:模式菌株及突变体的唑类杀菌剂EC50测定结果
- Table S8:实验所用培养基配方
- Table S9:供试杀菌剂信息,含抗性测定方法、使用场景等
- Table S10:病原菌分离株的遗传距离与地理分布数据
- Table S11:不同基因型方法解释的抗性表型方差比例
- Table S12:杀菌剂抗性表型(相对生长量与EC50)的相关性分析
- Table S13:CYP51基因转化用单倍型信息
- Table S14:同源重组验证用引物序列及参数
- 补充数据文件(Supplementary Data S1-S3):
- Data S1:Ku70基因质粒构建文件,含四环素阻遏蛋白、新霉素磷酸转移酶抗性基因等元件
- Data S2:Cyp51基因不同单倍型的质粒GenBank文件,含潮霉素抗性标记
- Data S3:GWAS关联分析原始数据,含SNP、SV、k-mer关联结果表格
- 压缩包文件(Supplementary_information.zip):ZIP格式,包含上述所有补充资料的归档文件
适用场景
- 植物病理学研究:分析小麦病原菌对唑类杀菌剂的抗性进化机制
- 分子遗传学研究:探究Cyp51等抗性相关基因的变异模式
- 农业应用研究:为小麦病害化学防治策略优化提供数据参考
- 生物信息学分析:验证病原菌抗性性状的GWAS关联分析方法