数据集概述
本数据集包含用于系统发育分析的相关数据,涉及分子序列数据的分区方案和替代模型的选择。数据支持对分区方案的客观选择,以提升系统发育重建的准确性,适用于大型多位点DNA数据集的分析。数据集共包含四个文件,分为压缩文件和文档文件两类。
文件详解
- 文档文件
- 文件名称:README_for_Table_1_and_2_datasets.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:包含Table 1和Table 2数据集的相关说明文档。
- 文件名称:README_for_Table_3_Li_2008.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:包含Table 3 Li 2008数据集的相关说明文档,提及使用raxml计算似然值的方法步骤,以及RaxML_info文件中包含用于计算AIC和BIC分数的似然值。
- 压缩文件
- 文件名称:Table_1_and_2_datasets.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含Table 1和Table 2对应的数据集压缩文件。
- 文件名称:Table_3_Li_2008.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含Table 3 Li 2008对应的数据集压缩文件。
数据来源
论文“PartitionFinder: combined selection of partitioning schemes and substitution models for phylogenetic analyses”
适用场景
- 系统发育分析: 用于选择分子序列数据的分区方案和替代模型,提升系统发育重建的准确性。
- 分子进化研究: 支持对大型多位点DNA数据集的分析,探究分子进化模式。
- 生物信息学工具验证: 验证PartitionFinder程序在客观选择分区方案中的性能。
- 进化生物学研究: 为进化生物学研究提供可靠的系统发育分析数据支持。