数据集概述
本数据集包含噬菌体T4和T7的从头测序原始数据与组装结果,由Illumina NextSeq 2x150和Oxford Nanopore技术生成,用于2021年11月线上举办的“噬菌体注释研讨会”。数据集共含4个文件,涵盖组装数据、参考序列及原始测序读段等内容。
文件详解
- 组装数据文件
- 文件名称:assemblies.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含噬菌体T4和T7的基因组从头组装结果文件
- 参考序列文件
- 文件名称:refs.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含噬菌体T4和T7的参考序列相关文件
- 原始测序读段文件
- 文件名称:T7_R2.fastq.gz
- 文件格式:GZ
- 字段映射介绍:噬菌体T7的Illumina NextSeq 2x150测序原始读段(R2端)压缩文件
- 测序读段压缩包
- 文件名称:reads.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含噬菌体T4和T7的原始测序读段文件
数据来源
Quadram Institute Bioscience(GitHub仓库:phage-annotation-workshop)
适用场景
- 噬菌体基因组注释教学:用于噬菌体注释研讨会的实操训练,学习基因组组装与注释流程
- 噬菌体基因组学研究:分析T4和T7噬菌体的基因组结构、基因组成及序列特征
- 测序技术比较分析:对比Illumina与Oxford Nanopore技术在噬菌体基因组测序中的表现
- 噬菌体参考序列构建:为噬菌体T4和T7的基因组研究提供标准化参考数据