全球海洋硅藻繁殖保守遗传标记数据集

数据集概述

本数据集围绕全球海洋硅藻繁殖的保守遗传标记展开,包含基因模型、转录组分析、蛋白序列等多类生物数据,支持对硅藻繁殖相关遗传机制的研究,为理解硅藻繁殖的分子基础提供数据支撑。

文件详解

  • README.txt:文档文件,说明数据集与研究论文的关联及各文件内容概述
  • Markers_profile_HMMs.zip:压缩文件,可能包含遗传标记的隐马尔可夫模型(HMM)数据
  • Marker_genes_protein_sequences.zip:压缩文件,含标记基因的蛋白质序列数据
  • Curated_gene_models.zip:压缩文件,含硅藻(如Skeletonema marinoi)的校正基因模型fasta文件
  • Comparative_transcriptomics.zip:压缩文件,含四种硅藻的差异表达分析及同源基因家族数据
  • Ecotaxa_IFCB_observation_sheet.xlsx:Excel文件,可能为Ecotaxa平台的IFCB观测数据表
  • Phylogenetic_selection.zip:压缩文件,含系统发育选择分析相关数据
  • Tara_MAG_coexpression.zip:压缩文件,含Tara海洋宏基因组组装基因组(MAG)的共表达分析数据
  • Scheldt_de_novo_transcriptome.zip:压缩文件,含Scheldt区域的从头转录组数据

适用场景

  • 硅藻分子生物学研究:分析保守遗传标记与硅藻繁殖的关联机制
  • 海洋生态学研究:探究全球海洋硅藻繁殖的分布特征及环境适应性
  • 比较基因组学分析:通过转录组数据对比不同硅藻物种的基因表达差异
  • 系统发育研究:基于基因序列数据构建硅藻的系统发育关系
  • 宏基因组学应用:结合Tara MAG数据研究海洋微生物群落中硅藻的功能角色
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 683.91 MiB
最后更新 2025年12月8日
创建于 2025年12月8日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。