数据集概述
本数据集基于瑞士三种常见橡树（Quercus petraea、Q. pubescens、Q. robur）的景观基因组学研究，通过94个基因的混合扩增子测序获取71个种群的3500余个单核苷酸多态性（SNPs）数据，分析其与地形、历史气候、土壤等非生物因素的关联，预测种群未来气候适应的非适应性风险（RONA）。数据集包含5个文件，支持植物适应性进化研究。
文件详解
- 文件名称：environmental_factors.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：记录与橡树种群局部适应相关的非生物环境因素，包括地形、历史气候、土壤特征等数据
- 文件名称：targets_SNP_allele_frequencies.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：包含目标候选基因中SNPs的等位基因频率数据，用于分析基因与环境因素的关联
- 文件名称：nSSR_genotypes.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：微卫星（nSSR）基因型数据，反映种群遗传多样性和结构特征
- 文件名称：cpSNP_allele_frequencies.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：叶绿体SNPs（cpSNP）的等位基因频率数据，用于研究母系遗传的种群分化
- 文件名称：amplified_reference_sequences.fasta
- 文件格式：FASTA
- 字段映射介绍：94个候选基因的扩增参考序列，为基因测序和SNP分析提供参考模板
适用场景
- 植物局部适应性研究：分析橡树种群基因变异与环境因素的关联，识别气候适应性候选基因
- 气候变化风险评估：通过RONA预测模型评估橡树种群未来气候适应的潜在风险
- 种群遗传结构分析：利用nSSR和cpSNP数据研究瑞士橡树种群的遗传多样性与分化特征
- 森林保护策略制定：为气候变化背景下的橡树基因资源保护和森林管理提供科学依据
- 进化生物学研究：探讨长寿命树种在环境变化中的适应性进化机制及基因流动的作用
