数据集概述
本数据集为Ras GTPase家族蛋白功能预测的生化验证研究配套数据，包含基于ProteinCartography v0.5.0生成的HRas和KRas蛋白结构分析结果，以及蛋白质图谱可视化文件，支持蛋白功能预测的验证分析。
文件详解
- 文件名称: GTPase_HRas_KRas.zip
- 文件格式: ZIP (.zip)
- 内容说明: 包含ProteinCartography配置文件、输入数据、结构数据及所有分析结果
- 文件名称: GTPase_HRas_KRas_aggregated_features_pca_umap_with_proteintype.tsv
- 文件格式: TSV (.tsv)
- 字段示例: protid（蛋白ID）、UMAP1（UMAP降维特征1）、UMAP2（UMAP降维特征2）、pdb_origin（PDB来源）、TMscore_v_P01112（与HRas的结构相似性）、TMscore_v_P01116（与KRas的结构相似性）等
- 文件名称: Ras_aggregated_UMAP_with_proteintype.html
- 文件格式: HTML (.html)
- 内容说明: 基于手动注释TSV文件生成的蛋白图谱可视化结果
适用场景
- 蛋白功能预测验证: 评估ProteinCartography工具对Ras家族蛋白功能预测的准确性
- 蛋白质结构分析: 研究HRas与KRas蛋白的结构特征及相似性
- 生物信息学工具开发: 优化蛋白功能预测算法的参数与流程
- 计算生物学研究: 探索UMAP等降维方法在蛋白质组数据分析中的应用
