人类诱导多能干细胞3D免疫荧光图像微型测试数据集2020

数据集概述

本数据集是人类诱导多能干细胞(hiPSC)的3D免疫荧光图像微型测试集,包含1个通道(DAPI核染色)、2个视野各2个Z层的图像,以及元数据文件和Fractal标准处理工作流,用于Fractal分析平台测试。

文件详解

  • 图像文件(PNG格式,共4个):
  • 20200812-CardiomyocyteDifferentiation14-Cycle1_B03_T0001F001L01A01Z01C01.png、20200812-CardiomyocyteDifferentiation14-Cycle1_B03_T0001F001L01A01Z02C01.png、20200812-CardiomyocyteDifferentiation14-Cycle1_B03_T0001F002L01A01Z01C01.png、20200812-CardiomyocyteDifferentiation14-Cycle1_B03_T0001F002L01A01Z02C01.png:均为40倍放大的免疫荧光图像,包含1个DAPI核染色通道,每个视野对应2个Z层。
  • 元数据文件:
  • MeasurementData.mlf:Yokogawa CV7000显微镜采集的测量数据元文件
  • MeasurementDetail.mrf:Yokogawa CV7000显微镜采集的测量详情元文件
  • 工作流文件:
  • fractal_example_workflow.json:Fractal平台的标准处理工作流文件,包含name(工作流名称)和task_list(任务列表)两个核心字段

数据来源

Pelkmans lab

适用场景

  • 生物图像处理算法测试:用于验证Fractal等平台对3D免疫荧光图像的处理能力
  • 干细胞成像技术研究:分析hiPSC核染色图像的采集参数与成像质量关系
  • 显微镜元数据分析:探究Yokogawa CV7000设备输出元数据的结构与应用
  • 计算生物学工作流开发:基于示例JSON文件构建或优化细胞图像分析流程
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 25.71 MiB
最后更新 2025年12月8日
创建于 2025年12月8日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。