数据集概述
本数据集基于核基因组目标捕获测序项目的脱靶 reads 构建质体基因组系统发育树，探究茜草科茜草亚科的进化关系及核质不一致性。包含一百二十个质体基因组序列，通过公共双端 Illumina 测序数据组装得到，支持亚族内及亚族间多数关系的解析，识别出核质不一致案例，为植物系统发育研究提供数据支撑。
文件详解
- README.md
- 文件格式：MD
- 字段映射介绍：包含数据集来源（DOI链接）、数据描述（一百二十个质体基因组序列的组装方式）、文件结构说明（plastomes_dryad.zip的内容）等信息
- plastomes_dryad.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：压缩文件夹，内含组装后的质体基因组序列，以包含fasta序列的.gff注释文件形式存储
数据来源
Dryad（DOI: 10.5061/dryad.mpg4f4r67）
适用场景
- 植物系统发育研究：用于解析茜草亚科内及亚科间的进化关系，验证或修正已有系统发育框架
- 核质不一致性分析：探究茜草亚科质体基因组与核基因组进化关系的差异及潜在原因
- 质体基因组结构研究：分析茜草亚科质体基因组的结构、基因含量及基因顺序保守性
- 进化生物学机制探讨：结合溯祖模拟分析，研究不完全谱系分选（ILS）与质体基因渐渗对系统发育关系的影响
