数据集概述
该数据集包含塞内加尔及邻近地区421份地理参考高粱地方品种的基因组数据,涉及213,916个单核苷酸多态性位点,用于研究其对萨赫勒半干旱气候与苏丹亚湿润气候的适应性基因组基础,识别了气候关联的选择信号及候选基因。
文件详解
- 文档文件:
- Faye-Supporting_Information_File_S1.pdf: PDF格式,可能为研究的补充信息文档,包含方法、结果等详细说明
- 数据文件:
- Faye-Supporting_Information_Data_S1.xlsx: Excel格式,补充数据文件1
- Faye-Supporting_Information_Data_S2.xlsx: Excel格式,补充数据文件2
- Faye-Supporting_Information_Data_S3.xlsx: Excel格式,补充数据文件3
- Faye-Supporting_Information_Data_S4.xlsx: Excel格式,补充数据文件4
- 其他文件:
- SNP_DataSet_ImpBeag4_SnSorghumGRIN.421_v1.0_MAF01.vcf: VCF格式,包含421份高粱品种的单核苷酸多态性(SNP)数据,最小等位基因频率为0.01
适用场景
- 作物遗传学研究: 分析高粱适应不同气候区的基因组选择信号
- 作物育种应用: 挖掘与干旱耐受性、光周期敏感性相关的候选基因,用于气候适应性品种选育
- 植物适应性进化研究: 探讨作物沿降水梯度扩散过程中的连续适应性机制
- 农业气候学研究: 解析气候变量对作物基因组变异的影响及关联位点