数据集概述
本数据集聚焦东非慈鲷鱼Astatoreochromis alluaudi的饮食诱导表型可塑性，通过转录组分析揭示机械应变塑造发育的分子基础。包含几何形态测量、qRT-PCR、RNA-seq转录本及线性形态测量四类数据，共4个文件，用于研究慈鲷鱼咽颌表型对硬/软饮食的适应性变化及转录调控机制。
文件详解
- 几何形态测量数据
- 文件名称：geometric morphometrics data.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：包含Id（样本编号）、RawCoord1-RawCoord18（原始坐标字段）等，记录慈鲷鱼表型形态的几何测量数据
- qRT-PCR验证结果
- 文件名称：qRT-PCR results.xls
- 文件格式：XLS
- 字段映射介绍：推测包含基因表达定量验证的结果数据，可能涉及目标基因、样本、Ct值、相对表达量等字段
- RNA-seq转录本数据
- 文件名称：RNA-seq transcripts.fasta
- 文件格式：FASTA
- 字段映射介绍：存储转录组测序得到的转录本序列信息，包含序列ID及核苷酸序列
- 线性形态测量数据
- 文件名称：linear morphometrics data.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：推测包含慈鲷鱼表型的线性测量指标数据，如体长、咽颌尺寸等形态学参数
数据来源
论文“Shaping development through mechanical strain: the transcriptional basis of diet-induced phenotypic plasticity in a cichlid fish”
适用场景
- 鱼类表型可塑性机制研究：分析慈鲷鱼咽颌表型对不同饮食的适应性变化规律
- 转录组调控分析：通过RNA-seq数据探究饮食诱导表型变化的关键基因及转录调控网络
- 形态测量数据分析：利用几何与线性形态测量数据，研究表型形态特征的量化差异
- 分子进化研究：探索表型可塑性在慈鲷鱼适应性辐射及物种形成中的作用机制
