数据集概述
本数据集包含西部 terrestrial 束带蛇（Thamnophis elegans）的转录组数据，通过焦磷酸测序技术生成，涵盖雌雄性别特异性转录本差异。数据经从头组装得到基因序列，结合注释分析识别性别特异性基因、SNPs、INDELs及进化相关基因，为爬行动物分子资源研究提供支持。
文件详解
该数据集包含12个文件，涵盖序列数据、注释结果、图表及补充文档，具体说明如下：
- 序列数据文件：
- 454Contigs_Newb_Mira_sing.fna：FASTA格式，包含经NEWBLER和MIRA组装的contigs及未组装的singletons序列
- 454AllContigs.fna：FASTA格式，包含所有组装得到的contigs序列
- 注释与变异数据文件：
- AnnoData_updated2010.08.16.xlsx：Excel格式，包含转录组注释数据，更新于2010年8月16日
- Add.file5_mapAnoCar1.xls：Excel格式，可能包含与AnoCar1基因组的比对注释数据
- Add.file7_Variants.xlsx：Excel格式，包含识别出的SNPs和INDELs变异数据
- 图表与分析结果文件：
- Add.file3_Graph-cluster.description.pdf：PDF格式，图聚类方法描述文档
- Add.file2_Dist.Reads.pdf：PDF格式，测序读长分布相关图表
- Add.file4_GOgraphs.pdf：PDF格式，基因本体（GO）分析相关图表
- Add.file6_Clustering.pdf：PDF格式，聚类分析结果图表
- Add.file9_sex-specificGOgraph.pdf：PDF格式，性别特异性基因的GO分析图表
- 样本信息文件：
- Add.file1_Table_Samples.doc：Word格式，样本信息表文档
- 性别特异性基因文件：
- Add.file8_ContigOfInterest.xlsx：Excel格式，包含感兴趣的contigs信息，可能涉及性别特异性基因
适用场景
- 爬行动物分子生物学研究：分析束带蛇转录组结构，挖掘进化相关基因
- 性别特异性基因研究：探究雌雄束带蛇转录本差异及性别相关基因功能
- 比较基因组学分析：与其他物种基因组比对，研究爬行动物独特进化性状的遗传基础
- 分子标记开发：利用SNPs和INDELs数据开发束带蛇种群遗传学研究的分子标记
- 基因注释与功能预测：通过GO分析等注释结果，预测未知基因功能及代谢通路
