数据集概述
本数据集为《水稻超级泛基因组图谱》研究的补充文件集，包含251份水稻材料的群体结构、共线性、高度分化区域、GC含量、测序深度及SNP数量等分析图表，支持对水稻基因组特征的深入解析。
文件详解
- Supplementary File1.Population structure of 251 rice accessions inferred by ADMIXTURE from K=6 to K=15.pdf：PDF格式，展示251份水稻材料基于ADMIXTURE（K=6至K=15）的群体结构分析图表
- Supplementary File2.The diagram of co-linearity for assembled genome against Nipponbare reference genome in 251 rice accessions.pdf：PDF格式，展示251份水稻组装基因组与日本晴参考基因组的共线性分析图表
- Supplementary File3. Highly divergent regions based on SV.xlsx：XLSX格式，记录基于结构变异（SV）鉴定的水稻基因组高度分化区域数据
- Supplementary File4. The diagram of SNP number and Nanopore reads depth per 100kb windows in 251 rice accessions.pdf：PDF格式，展示251份水稻材料每100kb窗口的SNP数量与Nanopore测序深度关联图表
- Supplementary File5. The diagram of GC content and the Nanopore reads depth per 10kb windows in 251 rice accessions.pdf：PDF格式，展示251份水稻材料每10kb窗口的GC含量与Nanopore测序深度关联图表
适用场景
- 水稻基因组结构研究：分析群体遗传结构、基因组共线性及高度分化区域特征
- 分子标记开发：基于SNP数量分布及测序深度数据挖掘潜在分子标记
- 基因组测序质量评估：通过GC含量与测序深度关联分析评估测序数据可靠性
- 泛基因组学研究：辅助解析水稻超级泛基因组的遗传多样性与进化机制
