数据18S核糖体RNA微生物群落分析示例数据集

数据集概述

该数据集为微生物生态学学习课程提供18S核糖体RNA测序数据,包含原始、去除测序引物的修剪后、以及修剪并子采样处理的序列读取数据,辅助学习者掌握微生物群落分析方法。

文件详解

  • 文件名称: DSEL15_SIPE1_18SV9_examples.zip,文件格式: .zip,可能包含原始测序读取数据
  • 文件名称: DSEL15_SIPE1_18SV9_examples_trimmed.zip,文件格式: .zip,可能包含已去除测序引物的修剪后测序数据
  • 文件名称: DSEL15_SIPE1_18SV9_examples_trimmed_subsampled.zip,文件格式: .zip,可能包含修剪并子采样处理后的测序数据
  • 文件名称: pr2_version_4.10.0_dada2_7tax.fa.gz,文件格式: .gz,可能为PR2数据库版本4.10.0的DADA2格式7级分类参考序列文件
  • 文件名称: fastqc.zip,文件格式: .zip,可能包含测序数据质量控制分析结果文件

适用场景

  • 微生物生态学教学: 用于学习18S rRNA测序数据处理与微生物群落分析流程
  • 生物信息学实践: 辅助掌握测序数据修剪、子采样等预处理方法
  • 微生物群落研究: 作为示例数据验证微生物多样性分析算法或工具
  • 数据库应用: 学习使用PR2等微生物分类参考数据库进行物种注释
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 359.06 MiB
最后更新 2025年12月4日
创建于 2025年12月4日
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