数据集概述
本数据集包含47G4（Hu19）单链抗体片段（scFv）二聚体及VL-VL二聚体的Alphafold2预测模型，展示了scFv二聚体的VH-VL结构互换特征，为抗体结构分析提供数据支持。
文件详解
- 47G4（Hu19）scFv二聚体模型文件：
- ranked_0.pdb至ranked_4.pdb：PDB格式文件，共5个，为Alphafold2预测的47G4 scFv二聚体最优模型，按AF2排名排序
- 5models_Hu19_scFv_AF2_icn3d_loadable.png：PNG格式文件，可通过iCn3D加载以叠加分析5个模型
- 47G4（Hu19）VL-VL二聚体模型文件：
- Hu19-VLVL-AF2-ranked_0.pdb至Hu19-VLVL-AF2-ranked_24.pdb：PDB格式文件，共25个，为Alphafold2预测的VL-VL二聚体模型，按AF2排名排序
- VL-VL二聚体相关模型文件：
- Hu19-VLVL-diabody-model.pdb：PDB格式文件，Alphafold2预测的47G4 scFv二聚体模型
- Hu19-inverted_VLVL-diabody-model.pdb：PDB格式文件，基于7JO8结构构建的反向VL-VL二聚体模型
- VLVLDIAB_VLINVDIAB_icn3d_loadable.png：PNG格式文件，可通过iCn3D加载以对比上述两个模型
- 参考文件：
- PDB-Igs-VLVL-asu+bu-with-over-10contacts.xls：XLS格式文件，记录了PDB中VL结构域接触数超10的抗体结构信息
适用场景
- 抗体结构研究：分析scFv二聚体的VH-VL结构互换特征
- 蛋白质模型验证：对比Alphafold2预测模型与已知晶体结构的差异
- 抗体工程应用：为47G4抗体的结构优化提供模型参考
- 计算结构生物学教学：作为Alphafold2模型分析的案例数据
