SMArt_Source_组蛋白H3K4三甲基化扰动自由能示例数据

数据集概述

本数据集为示例扰动自由能数据，用于展示SMArt工具包的模拟更新方案功能。数据内容为组蛋白H3K4赖氨酸三甲基化修饰与Sp100C PHD手指结合的扰动自由能相关信息，以GROMACS格式存储，包含一个压缩文件。

文件详解

• 文件名称：GROMACS_PHD_K4me.zip
• 文件格式：ZIP（压缩包）
• 字段映射介绍：压缩包内包含GROMACS格式的组蛋白H3K4赖氨酸三甲基化修饰与Sp100C PHD手指结合的扰动自由能数据，具体字段需解压后查看原始文件结构。

数据来源

SMArt toolkit（https://github.com/drazen-petrov/SMArt）

适用场景

• SMArt工具包功能演示: 用于展示SMArt工具包中模拟更新方案的使用方法和效果。
• 分子动力学模拟方法验证: 验证组蛋白修饰与蛋白质结合体系的自由能计算方法。
• 组蛋白-蛋白质相互作用研究: 分析组蛋白H3K4三甲基化修饰与Sp100C PHD手指的结合自由能特性。
• 计算生物学教学示例: 作为分子动力学自由能计算的教学案例，帮助理解扰动自由能模拟流程。