数据集概述
本数据集为蛇类科间系统发育关系研究的基因组数据，包含3776个核基因座的超保守元件序列，涉及29种蛇类（覆盖几乎所有科），是此前研究数据量的约100倍。数据用于解析蛇类主要类群间的亲缘关系，揭示了3个新分支，为脊椎动物系统发育研究提供支撑。
文件详解
- 序列文件（.phy格式）
- 文件名称：snakes_only_RAxML.phy、snakes_S1_0.75.phy、snakes_S2_0.60.phy
- 文件格式：PHY
- 字段映射介绍：包含蛇类物种的基因序列数据，用于系统发育分析
- 分析结果压缩包（.zip格式）
- 文件名称：snakes_only_NJst.zip、NJst_outgroups_3776_bs.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：压缩包内包含基于NJst方法的系统发育分析结果，可能涉及物种树构建、分支支持度等数据
- 文本文件（.txt格式）
- 文件名称：snakes_RAxML_outgroups.phy.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：包含带外类群的蛇类基因序列数据，示例内容显示物种名称（如micrurus_fulvius）及对应的碱基序列
数据来源
论文“Phylogenomic analyses reveal novel relationships among snake families”
适用场景
- 脊椎动物系统发育研究: 解析蛇类科间亲缘关系，验证或修正现有分类系统
- 基因组进化分析: 基于3776个核基因座数据，研究蛇类基因组的保守元件进化规律
- 生物信息学方法验证: 对比不同系统发育分析方法（如NJst、RAxML）对结果的影响
- 进化生物学教学: 作为系统发育基因组学研究的案例数据，辅助教学实践
- 物种多样性研究: 支撑蛇类多样性形成机制及演化历史的相关研究
