数据集概述
本数据集为论文“Multivariate QTL approach reveals a major regulator of terpenoid production and other volatiles in strawberry”的补充材料,包含草莓挥发性有机物(VOC)代谢组数据及多变量QTL研究结果,涵盖挥发性物质丰度、QTL定位、遗传标记等信息,2025年更新后优化了QTL分析方法并补充了遗传力估算等内容。
文件详解
- 补充数据1(Sup Data 1)
- 文件名称:Sup Data 1 - Reproducible results.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含可复现所有分析、结果及图表的代码文件夹,2025年更新后调整了QTL分析方法,仅保留混合模型结果,新增遗传力估算、QQ图等内容
- 补充数据2(Sup Data 2)
- 文件名称:Sup Data 2 - Volatile data.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:双亲子代群体和多样性面板(GWAS)群体的挥发性有机物丰度数据
- 补充数据3(Sup Data 3)
- 文件名称:Sup Data 3 - Total pvalue biparental.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:双亲子代群体中所有代谢物的p值表,包含trait(性状)、snp(单核苷酸多态性)、chr(染色体)、pos(位置)、pValue(p值)字段
- 补充数据4(Sup Data 4)
- 文件名称:Sup Data 4 - Total pvalue GWAS.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:GWAS群体中所有代谢物的p值表,字段包括trait、snp、chr、pos、pValue
- 补充表1(Sup Table 1)
- 文件名称:Sup Table 1 - Summary of metabolite abundance and heritabilities.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:两个群体中代谢物丰度及遗传力的汇总数据
- 补充表2(Sup Table 2)
- 文件名称:Sup Table 2 - Total QTL found.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:每个性状单独检测到的显著QTL信号数据
- 补充表3(Sup Table 3)
- 文件名称:Sup Table 3 - Summary QTL labels.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:按QTL位点汇总的显著QTL信号数据
- 补充表4(Sup Table 4)
- 文件名称:Sup Table 4 - Literature QTL.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:草莓中先前报道的VOC QTL,包含在Royal Royce基因组中定位的位置信息
- 补充表5(Sup Table 5)
- 文件名称:Sup Table 5 - Compound ID.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:本研究及先前研究中所有已鉴定化合物的元数据
- 补充表6(Sup Table 6)
- 文件名称:Sup Table 6 - SNP array positions imputed in the "Royal Royce" genome assembly.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:在Royal Royce基因组组装中定位的SNP芯片位置数据
- 补充表7(Sup Table 7)
- 文件名称:Sup Table 7 - Number of markers per chromosome.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:本分析中每条染色体的标记数量数据
数据来源
论文“Multivariate QTL approach reveals a major regulator of terpenoid production and other volatiles in strawberry”
适用场景
- 草莓挥发性代谢物遗传调控研究: 分析草莓挥发性有机物的遗传基础及QTL定位结果
- 植物代谢组学分析: 利用挥发性有机物丰度数据开展草莓代谢组学研究
- 分子标记辅助育种: 基于QTL定位结果开发草莓风味相关性状的分子标记
- 草莓风味性状改良: 解析萜类化合物等挥发性物质的主要调控因子,指导草莓风味改良
- 基因组学数据整合: 将SNP芯片位置与Royal Royce基因组进行整合分析
- 遗传力分析: 研究草莓挥发性代谢物性状的遗传力及遗传变异特征