数据集概述
本数据集为1型糖尿病（T1D）风险基因介导β细胞在促炎细胞因子刺激下存活机制研究的辅助数据，整合功能基因组学与人类遗传学方法，包含细胞因子响应性顺式调控元件、染色质互作、CRISPR筛选及SNP-SELEX等实验结果，共20个文件，支撑T1D风险相关基因及调控机制的研究。
文件详解
- 调控元件与染色质互作类
- 文件名称：Supplementary Data 1（胰岛cCRE列表）、Supplementary Data 2-4（β细胞共可及位点）、Supplementary Data 5（EndoC-BH1细胞染色质互作）
- 关联信息：部分文件同步于GSE205853，含细胞类型注释、细胞因子响应状态及启动子注释
- 基因筛选与表达类
- 文件名称：Supplementary Data 9（CRISPR-KO筛选结果）、Supplementary Data 10（ bulk ATAC-seq计数矩阵）、Supplementary Data 11（ bulk RNA-seq计数矩阵）
- 关联信息：同步于GSE205853，记录基因存活影响及表达量数据
- 单细胞测序类
- 文件名称：Supplementary Data 8（snATAC-seq条码及元数据）、Supplementary Data 12-17（α/腺泡/β/星状/内皮/δ细胞snATAC-seq计数矩阵）
- 关联信息：同步于GSE205853，含细胞类型特异性测序数据
- SNP与功能验证类
- 文件名称：Supplementary Data 6（SNP-SELEX候选变异）、Supplementary Data 7（SNP-SELEX TF结合结果）、Supplementary Data 18（荧光素酶实验结果）、Supplementary Data 19（SOCS1敲低qPCR结果）、Supplementary Data 20（SOCS1敲低流式结果）
- 内容说明：记录变异位点筛选、转录因子结合及基因功能验证数据
- 文件格式：含.txt、.xlsx、.tsv、.csv、.json等格式，覆盖矩阵、列表、实验结果等数据类型
数据来源
论文“Type 1 diabetes risk genes mediate pancreatic beta cell survival in response to proinflammatory cytokines”及GEO数据库（GSE205853、GSE118725）
适用场景
- 1型糖尿病分子机制研究：分析风险基因在β细胞炎症应答中的调控作用
- 胰岛细胞表观遗传学研究：探究细胞因子响应性顺式调控元件的功能及染色质互作模式
- 基因功能筛选：利用CRISPR-KO结果挖掘影响β细胞存活的关键基因
- 遗传变异功能验证：通过SNP-SELEX及细胞实验结果解析T1D风险变异的作用机制
- 糖尿病转化医学研究：为T1D靶向治疗靶点筛选提供数据支撑
