数据集概述
该数据集为突尼斯优良椰枣品种Deglet Nour的基因组草图,包含其基因组序列、编码序列、蛋白质序列及注释信息。通过与Barhee BC4参考基因组比对,识别出与成熟过程和果实品质相关的遗传变异,丰富了椰枣基因组资源,尤其填补了北非品种的空白。
文件详解
- 文件名称:Date_Palm_Deglet_Nour_proteins.fasta.zip
- 文件格式:ZIP压缩包(包含FASTA文件)
- 内容说明:可能包含Deglet Nour品种椰枣的蛋白质序列数据
- 文件名称:Date_Palm_Deglet_Nour_draft_genome.gff.zip
- 文件格式:ZIP压缩包(包含GFF文件)
- 内容说明:可能包含基因组注释信息,如基因位置、结构等
- 文件名称:Date_Palm_Deglet_Nour_CDS.fasta.zip
- 文件格式:ZIP压缩包(包含FASTA文件)
- 内容说明:可能包含编码序列(CDS)数据
- 文件名称:Date_Palm_Deglet_Nour_draft_genome.fasta.zip
- 文件格式:ZIP压缩包(包含FASTA文件)
- 内容说明:可能包含基因组草图的原始序列数据
适用场景
- 椰枣基因组学研究:用于分析Deglet Nour品种的基因组结构与功能
- 遗传变异分析:识别与果实成熟、品质相关的SNPs和INDELs
- 分子标记开发:为椰枣分子育种提供遗传标记资源
- 比较基因组学:与其他椰枣品种基因组进行比对分析
- 农业性状研究:探究关键农艺性状相关基因的核苷酸变异