外生菌根真菌ITS多序列比对补充材料

数据集概述

本数据集为研究外生菌根真菌核核糖体内部转录间隔区1(ITS1)中信号识别颗粒(SRP)RNA检测的补充材料,包含63条匹配ITS序列及3条新生成序列的多序列比对文件,采用NEXUS格式存储,用于展示序列结构组成。

文件详解

  • 文件名称: oo_88586.pdf
  • 文件格式: PDF (.pdf)
  • 文件内容: 包含基于MAFFT生成的多序列比对,涵盖部分nSSU(比对中1-34位碱基)、完整ITS1(35-678位)、完整5.8S(679-838位)、完整ITS2(839-1395位)及部分nLSU(1396位至结尾);SRP RNA位于比对中203-474位;文件仅作概览用,因分类阶元差异及ITS区域高变异性,不适合系统发育推断。

数据来源

Rosenblad MA等(2016)发表于MycoKeys的研究补充材料

适用场景

  • 分子真菌学研究: 用于查看外生菌根真菌ITS区域与SRP RNA的序列位置关系
  • 序列比对方法参考: 可作为MAFFT软件生成无手动调整比对结果的示例
  • 生物信息学教学: 辅助理解ITS区域结构组成及多序列比对文件格式(NEXUS)
  • 外生菌根真菌分类学辅助: 为相关类群(牛肝菌目、红菇目)的序列特征分析提供基础数据
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 0.15 MiB
最后更新 2025年12月12日
创建于 2025年12月12日
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