数据集概述
本数据集围绕外源性化学物暴露对大鼠肝脏长非编码RNA（lncRNA）调控网络的影响展开，包含通过RNA-seq技术分析27种不同作用机制化学物处理后，大鼠肝脏中lncRNA与蛋白编码基因的表达及相互作用数据，为研究外源性化学物的转录组干扰效应提供支持。
文件详解
- 转录组结构文件:
- Rat_lncRNA_GTF_Karri_Waxman_ToxSci_2020.gtf: GTF格式文件，包含5,975个大鼠lncRNA的基因结构和异构体信息，字段包括染色体名称、特征生成程序、特征类型、起始/终止位置等
- GTF_README.txt: 文本格式文件，提供GTF文件的字段说明和使用指南
- 表格数据文件（Excel格式）:
- Tables_S1-S3_Karri_Waxman_ToxSci_2020.xlsx: 包含研究中基础数据表格（S1至S3）
- Tables_S4-S7_Karri_Waxman_ToxSci_2020.xlsx: 包含研究中关键分析结果表格（S4至S7）
- Tables_S8-S11_Karri_Waxman_ToxSci_2020.xlsx: 包含lncRNA与蛋白编码基因关联分析表格（S8至S11）
- Tables_S12_Karri_Waxman_ToxSci_2020.xlsx: 包含第12号补充表格数据
- Tables_S13-S18_Karri_Waxman_ToxSci_2020.xlsx: 包含调控网络分析相关表格（S13至S18）
- 压缩数据文件:
- CSV_files_for_Tables_S1-S18_Karri_Waxman_ToxSci_2020.zip: 压缩文件，包含对应表格S1至S18的CSV格式数据
- 补充图表文件:
- Supplemental_Figs_S1-S12_Karri_Waxman_ToxSci_2020.pdf: PDF格式文件，包含研究的补充图表（S1至S12）
- Karri_Waxman_Suppl_Fig_Legends.pdf: PDF格式文件，提供补充图表的图例说明
适用场景
- 毒理学研究: 分析外源性化学物对肝脏转录组的干扰机制
- 非编码RNA功能研究: 探究lncRNA在化学物暴露后的调控作用
- 生物信息学分析: 用于lncRNA-蛋白编码基因共表达网络建模
- 肝脏毒理学机制研究: 解析化学物暴露与脂肪酸代谢、细胞分裂等通路的关联
- 跨物种调控网络比较: 基于同源分析研究大鼠与人类lncRNA调控网络的保守性
