数据集概述
本数据集为五瓣菟丝子(寄生植物)不同发育阶段(种子、幼苗、茎、吸器前体、吸器、花)的转录组从头组装及注释结果,通过分析关键基因类别(转运、胁迫响应、细胞壁修饰、激素相关等)的表达动态,揭示植物寄生过程的转录变化机制。
文件详解
- 转录组序列文件:
- Dodder_all_transcriptome.fa:FASTA格式,五瓣菟丝子全转录组序列
- Dodder_final_transcriptome.fa:FASTA格式,最终组装的转录组序列
- Dodder_predicted_CDS.fa:FASTA格式,预测的编码序列(CDS)
- 补充数据集文件:
- Supplementary Dataset 4.txt、Supplementary Dataset 7.txt、Supplementary Dataset 8.txt:TXT格式,包含基因表达数据(如Contig_id、Trinity_id及不同组织样本重复的表达值)
- Supplementary Dataset 5.xls、Supplementary Dataset 9.xls、Supplementary Dataset 12.xls、Supplementary Dataset 13.xls、Supplementary Dataset 14.xls、Supplementary Dataset 15.xls:XLS格式,补充数据表格
- Supplementary Dataset 6.xlsx.zip、Supplementary Dataset 10.xlsx.zip:ZIP压缩包,包含Excel格式的补充数据集
- 文档文件:
- Supplemental_figures.pdf:PDF格式,补充图表
- Supplemental_Tables.pdf:PDF格式,补充表格
适用场景
- 植物寄生分子机制研究:分析菟丝子寄生过程中的关键基因表达变化
- 寄生植物与宿主互作研究:探究菟丝子吸器形成、营养吸收相关基因功能
- 寄生杂草防控靶标筛选:识别可用于作物寄生杂草防治的潜在基因靶点
- 植物发育转录组分析:研究寄生植物不同发育阶段的基因表达调控
- 植物激素信号通路研究:分析菟丝子寄生过程中激素相关基因的表达动态