数据集概述
该数据集包含细胞色素bc1复合物Qo位点的初始分子构型文件与示例脚本，用于复现相关研究论文的结果。文件涵盖分子结构文件、数据文件、说明文档及代码脚本，支持使用pDynamo3库进行分子动力学模拟分析。
文件详解
该数据集包含九个文件，具体说明如下：
- 说明文档：
- README.pdf：PDF格式，提供数据集说明文档
- README.txt：TXT格式，提供数据集文本说明
- 分子构型文件：
- 147A_initial.pdb、141D_initial.pdb、152D_initial.pdb：共三个PDB格式文件，存储不同初始状态的分子结构数据
- 数据文件：
- 152D_initial.pkl、141D_initial.pkl、147A_initial.pkl：共三个PKL格式文件，存储初始状态的序列化数据
- 代码文件：
- QCMM_dynamics.py：PY格式，提供使用pDynamo3库进行QCMM动力学模拟的示例脚本
适用场景
- 生物化学研究：分析细胞色素bc1复合物Qo位点的质子转移机制
- 分子动力学模拟：复现氧化还原激活的质子转移过程模拟实验
- 蛋白质结构分析：研究Qo位点冗余网络的分子结构特征
- 计算生物学应用：验证pDynamo3库在生物大分子模拟中的应用效果
