数据集概述
本数据集包含西瓜尾孢菌（Cercospora citrullina）的基因组序列及相关分析文件。该真菌是导致葫芦科植物叶斑病的重要病原菌，数据集通过Illumina HiSeq 2500平台测序构建了其基因组草图，包含一百八十九个contigs，N50值为三万八千五百九十二bp，预测了八千八百五十六个基因，为后续群体基因组学研究提供资源。
文件详解
- 基因与蛋白序列文件：
- NGS_P5715_37-09_Predicted_genes.fasta：FASTA格式，包含预测的基因序列
- NGS_P5715_37-09_Predicted_proteins.fasta：FASTA格式，包含预测的蛋白质序列
- 基因组注释文件：
- NGS_P5715_37-09_Gene_coordinates.gff3：GFF3格式，记录基因坐标信息
- NGS_P5715_37-09_Genes_Annotation.xls：XLS格式，包含基因注释信息
- 功能分类文件：
- NGS_P5715_37-09_Molecular_function_summary.xls：XLS格式，分子功能分类汇总
- NGS_P5715_37-09_Cellular_component_summary.xls：XLS格式，细胞组分分类汇总
- NGS_P5715_37-09_Biological_process_summary.xls：XLS格式，生物过程分类汇总
- 其他数据文件：
- NGS_P5715_37-09_Organism_distribution_list.xls：XLS格式，物种分布列表
- Images.pptx：PPTX格式，包含相关图片资料
- Cercospora citrulina a brief out line of the data..docx：DOCX格式，数据集概要文档
适用场景
- 植物病理学研究：分析西瓜尾孢菌的致病机制及与宿主的互作关系
- 基因组学分析：开展该病原菌的基因功能注释、比较基因组学研究
- 农业应用：为葫芦科作物叶斑病的防控策略开发提供基因组学基础
- 进化生物学研究：探究西瓜尾孢菌的种群结构与进化历程
